房屋抵押贷款后被人民法院依法查扣，还是要继续还款的。因为房屋抵押贷款是你的房贷未还清，法院查封房产尚末处理，所以应继续偿货。
要继续还。抵押物灭失后，贷款还是要还的。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十四条被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权查封、扣押、冻结、拍卖、变卖被执行人应当履行义务部分的财产。但应当保留被执行人及其所扶养家属的生活必需品。采取前款措施，人民法院应当作出裁定。
借债还钱天经地义。如果抵押房产借债办理了抵押登记手续，司法查封房产无效。如果没有办理抵押，则查封有效。但是，借款仍需还。