用户在还款日当天错过自动扣款，如果第二天是还款宽限期，那么系统再次发起自动扣款时不会多扣。而第二天自动扣款属于逾期自动扣款，则除了扣除应还款的本金、利息之外，系统还会额外扣除逾期利息、违约金等费用。因此，还款日过后第二天系统是否会多扣款，主要是看扣款当天贷款是否逾期了。

贷款逾期后会产生逾期记录与逾期利息，系统在逾期的状态下自动扣款，自然会多扣一些。