主要区别是，性质不同、作用不同、特点不同，具体如下：
一、性质不同
1、LPR
是指贷款市场报价利率（原称贷款基础利率），是由具有代表性的报价行，根据本行对最优质客户的贷款利率，以公开市场操作利率（主要指中期借贷便利利率）加点形成的方式报价，由中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心计算并公布的基础性的贷款参考利率，各金融机构应主要参考LPR进行贷款定价。
2、基准利率
基准利率是金融市场上具有普遍参照作用的利率，其他利率水平或金融资产价格均可根据这一基准利率水平来确定。基准利率是利率市场化的重要前提之一，在利率市场化条件下，融资者衡量融资成本，投资者计算投资收益，以及管理层对宏观经济的调控，客观上都要求有一个普遍公认的基准利率水平作参考。
二、作用不同
1、LPR
疏通货币政策传导渠道，指导信贷市场产品定价。
2、基准利率
是利率市场化机制形成的前提和核心。
三、特点不同
1、LPR
LPR市场化程度较高，能够充分反映信贷市场资金供求情况，使用LPR进行贷款定价可以促进形成市场化的贷款利率，提高市场利率向信贷利率的传导效率。
2、基准利率
（1）、市场化：基准利率必须是由市场供求关系决定，而且不仅反映实际市场供求状况，还要反映市场对未来的预期。
（2）、基础性：基准利率在利率体系、金融产品价格体系中处于基础性地位，它与其他金融市场的利率或金融资产的价格具有较强的关联性。
（3）、传递性：基准利率所反映的市场信号，或者中央银行通过基准利率所发出的调控信号，能有效地传递到其他金融市场和金融产品价格。
Ipr本身就是商贷的一种，商贷利率可以是固定的，也可以是浮动利率，lpr是浮动的，是央行存贷款利率的基准利率，是浮动的