二套房申请公积金贷款要付多少首付款，这需要看贷款人当地公积金中心的要求怎么样，一般来说申请公积金贷款的首付比例是20%——50%之间，不同的地区会有差异，所以贷款人在申请公积金贷款买房以前，可以先去咨询当地的公积金中心了解情况。

第二套房使用公积金贷款，可能需要比首套房更对的首付，另外在贷款利率上面，二套房的公积金贷款利率对比首套房也会上浮一点，不过就算是这样对比商业贷款还是有不少的优惠。

不过在贷款人申请二套房公积金贷款的时候，一定要注意名下不能够有还未结清的公积金贷款，如果有还未结清的公积金贷款，那么再去申请公积金贷款的话就会被公积金中心拒绝。

公积金中心会对申请人的资质做比较详细的调查，想要申请到贷款，必须要满足相关的要求才行，贷款人需要做好准备。