房产证抵押贷款肯定需要扣押的，不是扣在房管局，是抵押在货款银行。因为房管局是不能货款的，只能办理房产证，并且房管局了民没有资金发放货款。

如果是按揭房，在按揭款没有还清前，办理的房产证是由货款银行收去作低押了。只要你还清货款后，银行会将房产证归还你的。