银行跨行转账手续费是在汇款方扣除的，不同银行手续手续费标准不同，以农业银行为例：

1、手机银行：个人手机银行跨行转账是不收取手续费的。

2、网上银行：5000元（含）以下不收取手续费；5000元（不含）以上普通转账，按柜台标准的四折收取手续费；5000元（不含）以上实时转账，按普通转账收费标准上浮20%收取，最高不超过20元。

3、柜台/ATM机转账：2000元（含）以下，单笔手续费为2元；2000元-5000元（含），单笔手续费为5元；5000元-10000元（含），单笔手续费为10元；10000元-50000元（含），单笔手续费为15元；50000元以上，单笔手续费按转账金额的0.03%收取，最高不超过50元。