学费已经交了,助学贷款下来又扣了款,可以在贷款下来以后,去学校的财务部拿着缴纳学费的发票申请全额退款。当事人可以主动联系学校辅导员。一些高校确实会存在这样的问题,这些都是工作上面的疏忽。辅导员会让去找学校的财务部门把这个情况向有关的工作人员反映一下。