没关系，公积金交费自动扣款晚了那是因为系统的问题，交费那一天是周末那么系统会直接跳到下周一再给你扣款的。

公积金贷款职工由于各种原因还款日忘记还款或未足额还款的，当月需在公积金贷款还款卡中足额存入相应还款金额，以避免逾期。

注：对于已签订公积金冲还贷协议的贷款职工，如因个人公积金账户余额不足导致错过还款日还款或未能足额还款的，即便单位在还款日当日或之后缴存住房公积金，也无法再次从该个人公积金账户中冲还当月公积金还款金额。职工需在公积金贷款还款卡中足额存入相应还款金额，以避免逾期。

1、如果是因为单位缴纳的公积金扣款日余额不足的话，可以在规定的期限之内进行补交。但是根据中国《住房公积金管理条例》的相关规定，单位需要按时、足额的为职工缴纳住房公积金款项，是不能迟交或是少交的；

2、如果是因为个人账户中的余额不足而导致银行无法进行扣款，那么银行将会把逾期信息记录在个人征信记录中。