毕业时学生还款有两种方式，一种是一次性还款，就是把所有贷款一次性还清，不需要利息；另一种是分期还款，毕业前贷款银行会和你签一份还款协议或者发给你一份告知书，告诉你每月应还款的金额，然后你按要求每月将钱打入银行事先发给你的银行卡中就可以了。至于你说的网上填写毕业申请，银行没有此类要求，可能是你们学校的大学生资助中心为了统一操作实施的方法，具体你可以咨询你们学校的学生处。