2021年夫妻分居期间公积金按揭贷款应该由夫妻双方协商处理。夫妻分居就意味着双方矛盾已经很深，需要双方分开冷静一下，考虑一下以后是继续生活在一起，还是以后彻底分开。都会考虑一下财产分配问题，包括正在按揭中的房子。正常情况下，应该还是按原来的还款方式进行。或以后房子归哪方，贷款就由谁来还了。

这要看夫妻双方谁的住房公积金高，谁高谁多按揭多一点吧主要是夫妻共同努力。夫妻不和怎么都么用