贷款存晚了，系统也会发起自动扣款。在还款日当天，系统会发起多次自动扣款，即使用户错过了之前的自动扣款，在还款日的当天，系统还会发起自动扣款。虽然说，系统会发起多次自动扣款，但是自动扣款的次数也就是2-3次，而错过了所有的自动扣款，当天系统就不会再扣款了。

这时候用户就需要主动还款，主动还款成功，贷款机构也会视为用户按时还款。大部分的贷款自动扣款的时间都是有规律可循的，用户只要掌握了自动扣款的时间，选择在扣款之前存好钱，那么就不会错过自动扣款。当然，自动扣款失败后，选择主动还款也是可以的。

自动扣款或者主动还款都只是还款方式，用户只要按时还款了，那么个人征信就不会受到影响。个人征信没有受到影响，用户就可以积极维护个人征信。